Prévalence et résistance aux antibiotiques de souches de bacilles à Gram négatif isolés à partir des fruits et légumes

Abstract

Le rôle des aliments dans l’exposition humaine à des bactéries résistantes aux antibiotiques est un problème de sécurité alimentaire important. L’objectif principal de notre étude était l’évaluation de la contamination des fruits et légumes par des bacilles à Gram négatif résistants aux céphalosporines de troisième génération, et la caractérisation phénotypique et moléculaire des mécanismes de résistance aux antibiotiques chez ces bacilles à Gram négatif. Un total de 491 échantillons de fruits et légumes issus de 5 marchés et 7 fermes maraichères de Bejaia, côte nord-est de la Méditerranée algérienne, ont été analysés. Un total de 90 échantillons de sol et 45 échantillons d'eau d'irrigation issus de 7 différentes fermes ont été également analysés. L’ensemble des méthodes et techniques réalisées ont permis l’isolement de bacilles à Gram négatif multirésistants aux antibiotiques. Les bactéries isolées dans les fruits et les légumes, le sol et l'eau d'irrigation collectées dans les fermes étaient presque toutes des espèces bactériennes non fermentaires. Une plus grande diversité d'espèces bactériennes et de profils de résistance aux antimicrobiens a été observée sur les marchés ; les Enterobacteriaceae étaient aussi fortement représentées que les bactéries non fermentaires. Parmi les Enterobacteriaceae, les isolats de K. pneumoniae étaient des producteurs de bêtalactamase à spectre étendu (BLSE). Le séquençage du génome entier a permis l’identification de blaCTXM-15 dans 11 souches de BLSE et blaDHA dans deux pAmpC. Le gène aac(6’)Ib-cr a été identifié dans 8/13 souches de Klebsiella pneumoniae. Les clones détectés sont de cinq types : ST14, ST45, ST219, ST236 et le ST882. Cette étude a montré que les fruits et légumes peuvent constituer un réservoir de bactéries à Gram négatif multi-résistantes, qui peuvent être transférées à l'homme par la nourriture, ce qui peut représenter une menace sous-estimée pour la santé publique. Cette étude souligne que les mesures d'hygiène lors de la récolte et de la vente sont d'une importance capitale pour limiter la propagation de bactéries multirésistantes aux consommateurs.